Uno de los puntos fuertes de Filr es su capacidad para integrarse con sus servicios de directorio existentes, ya sea Microsoft Active Directory, NetIQ eDirectory o una combinación de ambos.
Filr se puede sincronizar con estos servicios de directorio para simplificar la creación de usuarios de Filr, agrupando automáticamente los requisitos de control de acceso y autenticación existentes. Filr utiliza la configuración de los servicios de directorio tal cual está definida. No necesita volver a configurar las extensiones del esquema ni ningún directorio.
El personal de TI puede además agregar usuarios locales, como partners, trabajadores temporales o usuarios que no estén incluidos en el directorio de la empresa.